ביה"ס למדעי הים ע"ש צ'רני, חרט על דגלו את המטרה של הכשרת הדור הבא של מדעני העתיד ואנשי מקצוע בתחומים הנדרשים לפיתוחים ומחקר של מדעי הים.
הפעילות הרב תחומית בדיסציפלינות חיוניות ובעלות אספקטים יישומיים יוצרת הזדמנויות תעסוקתיות מגוונות.
בוגרי התארים המתקדמים של בית הספר מובילים כיום את המחקר, התעשיה, הכלכלה, הביטחון והממשל הישראלי והעולמי ומשתלבים בחברות המובילות בעולם.
השפעתם העכשווית והעתידית על ההחלטות הנוגעות לשימוש בים, מחצביו, נכסיו התרבותיים, סביבתו וחופיו הינה עצומה ומבוססת על הבנה סביבתית, כלכלית וטכנולוגית רחבה במדיום הימי.

בוגרי החוג לטכנולוגיות ימיות ימצאו תעסוקה בחברות הנדסיות ביטחוניות המטפלות בנושאים ימיים צבאיים, בחברות עתירות ידע וחברות הזנק המפתחות סנסורים, עיבוד נתונים, אוטונומיה ועוד. 

בוגרי החוג למדעים גיאו-ימיים ימצאו תעסוקה בתעשיית הגז והנפט, מכוני מחקר ממשלתיים (מכון גיאולוגי, מכון גיאופיזי, חקר ימים ואגמים), משרד האנרגיה, חברות הנדסיות, ייעוץ סביבתי, חברות/עמותות ירוקות/איכות סביבה, משרדי ממשלה, ניטור, מגוון עבודות ימיות, אקדמיה והוראה.

בוגרי החוג לביולוגיה ימית ימצאו תעסוקה בחברות ביוטכנולוגיות, חברות/עמותות ירוקות/איכות סביבה, משרדי ממשלה ומכוני מחקר ממשלתיים, ייעוץ סביבתי, ניטור, מגוון עבודות ימיות, אקדמיה והוראה. 

בוגרי החוג לביוטכנולוגיות כחולות וחקלאות ימית מקיימת ימצאו תעסוקה במוסדות מחקר או בחברות המובילות בתחומי הביוטכנולוגיה והפרמקולוגיה, החקלאות הימית וכן בתחומי שמירת טבע בסביבה הימית. 

בוגרי התכנית לתואר שני באסטרטגיה ימית ימצאו תעסוקה במסגרת המערכת הביטחונית (צה"ל, משרד הביטחון, יחידות הסמך של המשרד והתעשיות הביטחוניות), משרדי הממשלה השונים (תחבורה, הגנת הסביבה, כלכלה, אנרגיה), חברות פרטיות וגופים ציבוריים שתחום עיסוקם במרחב הימי (כדוגמת צי"ם, נמלי ישראל ועוד), עם אתגרים קיימים ומתפתחים של מדינת ישראל והמגזר הימי בכל הקשור לפעילות במרחב הימי.